Des universités irlandaises ont fait l'objet de critiques pour leurs liens avec des régimes corrompus et moralement contestables. L'ancien directeur du campus de Bahrain à la Faculté royale de chirurgie en Irlande (RCSI) a déclaré que des institutions irlandaises de troisième niveau étaient "intimement liées à des régimes qui ne respectent pas les droits de l'homme".

Des versements irréguliers d'allocations, de primes, de retraites majorées à certains membres du personnel universitaire pendant plusieurs années ont été révélées par un rapport de l'observatoire des dépenses publiques irlandais, le Contrôleur et l'Auditeur général.

Le gouvernement irlandais a mis en garde les autorités éducatives de Malaisie contre un établissement privé d'enseignement supérieur situé à proximité de Kuala Lumpur. D'après l'ambassadeur d'Irlande en Malaisie, la Irish International University ne dispense aucun cours ni enseignement en Irlande et n'est pas une université irlandaise.