Según un riguroso estudio que lleva por título Provisión Efectiva de los Servicios Públicos en el Sector de la Educación, el progreso conseguido en el sistema educativo de Mozambique en los últimos veinte años se está viendo amenazado a causa del desvío de fondos, fraude relativo a la admisión escolar y la concesión de contratos de obras de construcción, así como por casos de extorsión sexual a cambio de buenas notas. Los autores de la investigación subrayan la urgente necesidad de implementar una legislación contra la corrupción.

El asesor legal de la Universidad Eduardo Mondlane negó que hubiera algo deshonesto en asignar becas a personas que no trabajan en la universidad. Sin embargo, solo en 2003 se gastó presuntamente más de US$ 147.000 en la hija del rector, dos hijos del director de relaciones públicas de la universidad y 16 otras personas, en lugar de utilizarse para que los profesores obtuvieran títulos en el exterior.