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En Alemania, el número de universidades privadas se ha duplicado en las dos últimas décadas, hasta alcanzar las 115, y el número de estudiantes se ha cuadruplicado. Estas instituciones se financian a partir de diversas fuentes, como empresas y fondos familiares. Aunque las universidades afirman que su independencia académica se mantiene intacta, han surgido problemas de transparencia. Transparencia Internacional advierte contra la posible influencia de las empresas en la investigación a través de su financiación e insta a una mayor transparencia para preservar la integridad académica.

En una sorpresiva movida, el presidente de la Universidad Johannes Gutenberg de Maguncia, en Alemania, anunció esta semana planes de revisar el controversial contrato gobernando el uso de una donación de €150 millones de parte de una fundación filantrópica. Críticos argumentan, que el acuerdo le da demasiado control al donante sobre decisiones de publicaciones y nombramientos de profesorados en el Instituto de Biología Molecular de la escuela, la cual la fundación ayudó a crear en el 2009. La movida, que pudiera influenciar a acuerdos de financiación similares en otras universidades, solo satisface a los críticos en cierta medida. Ellos están empujando a más transparencia de parte de las universidades y sus donantes.