Tras una auditoría del primer control de calidad del programa de colocación avanzada emprendida por el Consejo de la Universidad, algunos profesores se encontraron con la sorpresa de que sus cursos fueron rechazados. Los resultados de la auditoría no han mejorado las ya tensas relaciones entre algunos profesores de nivel secundario del programa de colocación avanzada y los profesores de nivel universitario que los evalúan.

La herencia soviética en Georgia y el colapso ulterior de las instituciones estatales generó un sistema educativo plagado de corrupción, nepotismo, centralización y falta de profesores. Además, durante la década de los noventa se expandieron escuelas privadas de baja calidad con nombres de 'universidad' o 'instituto'. Han surgido controversias tras el cierre o la fusión de colegios y universidades, y la abolición de miles de puestos académicos o administrativos.

Un tercio de los profesores de la Universidad de Derecho de Kragujevac, su decano y el asistente del ministro de educación superior fueron objeto de sobornos. Este escándalo sin precedentes siembra la duda sobre el valor de algunos diplomas de abogados y la calificación de algunos jueces.

La universidad "Laique Advantiste de Kigali" (Unilak) desafío una directiva del Ministerio de Educación que exige la presentación de los títulos académicos de los profesores reclutados con fines de verificación. Según fuentes del ministerio, la dirección de la universidad sigue reclutando estudiantes. La Unilak ha obtenido una autorización provisoria, pero el ministerio no le ha reconocido el derecho a otorgar diplomas, aduciendo que carece de la capacidad para asegurar una educación de calidad.

Tras varios informes periodísticos que señalan que miles de egresados de la Universidad de Makerere podrían haber cometido fraude, varios empleadores han recurrido a la oficina de transcripción para verificar los títulos universitarios. Según un empleado de la Oficina de Registro Académico, banqueros, funcionarios de aduana y periodistas han conseguido puestos que nunca deberían haber obtenido.

El Ministerio de Educación ordenó la auditoría de los responsables de las universidades a partir de 2007. Los analistas afirman que la medida está destinada a refrenar la corrupción, tras la reciente revelación de varios casos de desfalco. En 2006, el ex presidente de la Universidad de Tianjin fue destituido de su puesto de diputado en el Congreso Nacional del Pueblo por su responsabilidad en la pérdida de US$ 12 millones en la institución a su cargo.