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Un universitaire nigérian de renom a déclenché un vif débat après avoir ouvertement critiqué l’agence nationale d’accréditation des universités pour son manque d’autonomie, ses négligences et son double système de notation des cours – allégations toutes réfutées par l’agence. Le professeur accuse la National Universities Commission (NUC) de se transformer en simple porte-parole du gouvernement et de ne pas être à la hauteur de sa mission réglementaire visant à garantir des universités de qualité. Selon lui, la NUC est complice de pratiques corrompues entourant la délivrance de ses accréditations, certains de ses agents « recevant des enveloppes brunes » (autrement dit, des pots-de-vin), ce qui remet en cause sa crédibilité.

Le Ministère de la recherche, de la technologie et de l’enseignement supérieur a déclaré que les élèves diplômés d’universités dont l’activité est suspendue suite à des violations diverses ne recevraient pas de diplômes reconnus par l’état. Le ministère a annoncé que 239 universités jugées problématiques ne sont plus en activité, ce qui implique qu’elles ne recevront plus de services du ministère tels que des subventions, des certifications pour leurs enseignants et des bourses d’études. Le ministère refusera également les propositions d’accréditation ou les nouveaux programmes d’études.

Le cabinet italien a exigé la mise en place d'un système national d'accréditation des universitaire afin d'éradiquer le népotisme. Dans ce système, des commissions constituées de cinq universitaires expérimentés seront chargés d'accréditer les candidats en tant que professeurs ou professeurs associés sur la base de la qualité et de la quantité de leur production académique.

L'université laïque adventiste de Kigali (Unilak) refuse de se plier à une directive du ministère de l'Éducation qui lui impose de présenter les titres universitaires des assistants qu'elle a recrutés, à des fins de vérification. Selon des sources au sein du ministère, la direction de l'université continue à recruter des étudiants. L'Unilak a obtenu une autorisation provisoire mais le ministère refuse de lui reconnaître le droit de délivrer des diplômes, au motif que l'université n'a pas les moyens d'assurer une éducation de qualité.

Des interviews de 43 recteurs, vice-recteurs et administrateurs de 5 universités privées ont été menés au printemps 2004. Le consensus qui s'en dégage est qu'à de rares exceptions près, la corruption, quelle qu'en soit la forme, est un passage obligé pour obtenir une licence ou une accréditation. Le montant des pots-de-vin à verser peut atteindre 200 dollars des E.U. pour une licence, soit deux mois de salaire d'un universitaire moyen, et un « pourboire » 10 à 20 fois plus élevé pour une accréditation.