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Selon une enquête menée par Education Sub-Saharan Africa (ESSA), la plupart des universités d'Afrique de l'Est ont eu du mal à garantir l'intégrité des examens administrés en ligne pendant la pandémie du COVID-19. Le chef de l’enquête de l'ESSA rapporte que des étudiants ont utilisé du matériel interdit pendant les examens ou ont enfreint les règles d'examen de l'université. L’Ouganda et le Kenya étaient les pays avec le plus grand nombre d'universités en difficulté, respectivement 31 % et 27 %.

Plus de 100 étudiants de l’université privée KIM à Kigali (Rwanda) se sont vu refuser l’obtention de leur diplôme en juillet 2021 après que les autorités ont découvert qu’ils avaient modifié leurs notes dans le système informatique de l’université. Selon la commission d’enquête du Rwanda, les suspects sont accusés d’avoir falsifié des documents et encourent 5 à 7 ans de prison ainsi que des amendes de 3 à 5 millions de francs rwandais (environ 5 000 dollars US).

Au Rwanda, les affaires de plagiat dans les universités sont en baisse. Les étudiants sont désormais tenus de soumettre leurs travaux et thèses à l’examen d’un logiciel anti-plagiat, Turnitin, avant de les présenter à l’examen de fin d’année. Un travail ne doit pas contenir plus de 15 % d’occurrences assimilées à du plagiat, au risque sinon pour l’étudiant d’être disqualifié et privé de diplôme.