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Les cas de fraude dans le domaine scientifique au Brésil ont augmenté de manière importante entre 2009 et 2012, selon une étude qui enquête sur le retrait d’articles dans les revues scientifiques. L’étude s’est focalisée sur les articles de recherche qui ont été retirés de deux des principales bases de données latino-américaines et caribéennes. Des 2000 articles provenant du monde entier publiés dans ces bases de données entre 2009 et 2014, 31 ont été retirés ultérieurement, y compris 25 du Brésil. L’étude, parue dans la revue « Science and Engineering Ethics » dit que ceci pourrait mettre en danger la popularité croissante du pays en tant que partenaire de recherche.

Les procureurs fédéraux enquêtent sur un accord passé entre une université fédérale brésilienne et une compagnie pétrolière publique pour sous-traiter, via une fondation académique, des fonctionnaires censés travailler uniquement pour l'université. Cependant, après que l'enquête ait révélé de nombreuses irrégularités et fraudes, des groupes d'enseignants du supérieur au Brésil ont nié qu’il y ait un manque de transparence dans les relations entre les universités publiques et les entreprises privées.